Джей пытается привыкнуть к новости о беременности Ким, хотя будущая роль отца пугает его сильнее, чем он готов признать. Пока они спорят о совместной жизни и возможном переезде Ким ради работы, в больнице тоже хватает перемен. Кокс ищет способ сдерживать агрессию, а Карла, став матерью, думает, сможет ли вернуться к прежней работе. Эллиот берётся помогать ей с родами, пробует себя в частной практике и сталкивается с пациентом-врачом, который уверен, что лучше всех знает собственный диагноз. Тёрк, Келсо и Уборщик по-прежнему превращают обычные дежурства в отдельные испытания для Джей и Эллиот.

Джей и Ким решают, как строить жизнь после новости о ребёнке.
Кокс пытается справиться с яростью, не теряя авторитета врача.
Эллиот помогает Карле с родами и начинает принимать частных пациентов.
Карла сомневается в возвращении в больницу, а Тёрк ищет баланс дома.

Шестой сезон заметно смелее играет с формой: больничная комедия внезапно превращается в мюзикл, а знакомые события получают новые версии через чужие взгляды и воспоминания. При этом юмор не отменяет серьёзных разговоров о родительстве, браке, работе и страхе ошибиться в профессии. Джей взрослеет под давлением ответственности, Ким и Эллиот принимают непростые решения, а Карла и Тёрк учатся жить в новом семейном ритме. Даже Кокс, Келсо и Уборщик оказываются втянуты в перемены, которые не удаётся переждать в привычной больничной суете.